Emily Byrne versucht herauszufinden, was während ihrer Zeit in Gefangenschaft geschehen ist. Unterdessen wird Boston von einem Anschlag erschüttert, zu dessen Aufklärung Emilys Exmann Nick Durand und das FBI hinzugezogen werden.
Nick (Patrick Heusinger) und Team versuchen die Person aufzuspüren, die die Regierung angegriffen hat. Ein Schatten aus der Vergangenheit droht Emilys (Stana Katic) wankende Ausgeglichenheit aus der Balance zu bringen.
Emilys (Stana Katic) Ermittlungen in ihrer Vergangenheit entwickeln sich zur Jagd nach einem Serienmörder, dessen Verbrechen im Chaos der Stadt untergegangen sind. Als er sich ein Opfer aus Emilys Umfeld aussucht, kehrt sie zum FBI zurück und schließt sich mit Sonderermittler Cal Isaac zusammen. Doch der ehemalige Navy SEAL hat seinen ganz eigenen Kopf.
Emily (Stana Katic) und Cal Isaac (Matthew Le Nevez) ermitteln im Fall des Fentanyl Killers und geraten dabei an einige sehr gefährliche und hochtalentierte Verdächtige. Anderswo nimmt Nicks Suche nach dem Federal Annex-Angreifer Fahrt auf.
Emily (Stana Katic) findet ein wichtiges Beweisstück während sie das Haus des letzten Opfers des Fentanyl-Killers durchsucht. Nicks Arbeit mit einem wichtigen Gefangenen endet tödlich.
Emily (Stana Katic) und Cal Isaac (Matthew Le Nevez) reisen nach Moldawien um den Fentanyl-Killer zu finden. Eine Aufgabe, die gefährlicher ist als sie scheint. Nick (Patrick Heusinger) bekommt eine Aufgabe, die seinen moralischen Code herausfordert.
Emily (Stana Katic) und Cal Isaac (Matthew Le Nevez) versuchen unterzutauchen während sie Rex Wolfe tief in die Unterwelt folgen. In den USA tut sich Nick (Patrick Heusinger) schwer damit, eine massive Lüge zu schlucken.
Emily (Stana Katic) muss einen weiteren, furchtbaren Verlust verarbeiten. Doch ihre Trauer wird schnell zu Antrieb als sie erkennt, dass Rex Wolfe nur die Spitze eines Eisbergs war.
Emily (Stana Katic) erfährt, dass Rex (Andrew Brooke) für jemanden gearbeitet hat, der sowohl mit ihrer Vergangenheit als auch mit ihrer Gegenwart etwas zu tun hat. Später ist Emily gezwungen, zu verzweifelten Maßnahmen zu greifen.
Emily (Stana Katic) gerät mit ihren Ermittlungen an ein totes Ende. Trotzdem folgt sie den verbleibenden Beweisstücken zu einer überraschenden Offenbarung.