Staffel 2

Allen und die anderen Exorzisten brechen mit Anitas Schiff nach Japan auf. Nachdem sie den Hafen verlassen haben, treffen sie jedoch auf einen großen Schwarm Akuma.

Allen und Lenalee erfahren, was mit Suman Dark passiert ist, er war ein Exorzist, welcher seine eigene Einheit angegriffen hatte und nun verschwunden ist. Trotz allem beschließen Allen und Lenalee, ihn zu retten.

Sobald Allen frei ist, versucht Allen, Suman davon abzuhalten, weitere Zerstörung anzurichten. Währenddessen bittet Lenalee Komui um Informationen über den Gefallenen.

Allen versucht, Suman daran zu hindern, ein nahegelegenes Dorf zu zerstören, indem er die Synchronisationsrate seines Innocence auf das Leistungsmaximum erhöht. Während er darum kämpft, die Gefallenen zu stoppen, kehrt Allens Innocence in den Normalzustand zurück und wird schwer beschädigt, was ihm starke Schmerzen zufügt. Währenddessen erfährt Lenalee von Komui die Wahrheit über den Gefallenen und Sumans Schicksal.

Der riesige Körper von Suman beginnt zu zerfallen, und Allen verschwendet keine Zeit damit, seinen Innocence zu aktivieren, doch leider beginnt sein Arm unter starken Schmerzen zu leiden, als er versucht, Sumans Innocence zu entfernen. Wie durch ein Wunder gelingt es Allen, Suman und seinen Innocence aus dem Körper zu befreien. Suman ist noch am Leben, aber leider ist sein Geist verloren.

Nachdem Allen gesehen hat, wie Suman vor seinen Augen zerfällt, begegnet er Tyki Mikk, der nicht nur die teuflischen Schmetterlinge namens Tease kontrolliert, sondern auch die Fähigkeit besitzt, nach Belieben durch alles hindurchzugehen. Er reißt Allen den linken Arm ab und vernichtet seinen Innocence. Da Allen weiß, dass im nicht viel Zeit zum Leben bleibt, befiehlt er Timcanpy, mit Sumans Innocence zu fliehen. Tyki findet mit Hilfe seines kleinen Kartenwächters, Cell Roron, heraus, dass Allen auf seiner Todesliste steht, daher stößt er seine Hand in Allens Herz, wodurch ein Loch entsteht, welches ihn langsam tötet. Als der Mond in den Wald scheint, stolpert ein rosahaariges Mädchen über den sterbenden Allen...

Nach der Rettung von Timcanpy vor den verbliebenen Akuma folgen Lavi und Lenalee, Timcanpy, dort müssen sie jedoch feststellen, dass Allen nicht mehr dort ist. Timcanpy zeigt Lavi und Lenalee, Erinnerungen was vorgefallen war, die beiden Exorzisten sind zutiefst beunruhigt. Bei ihrer Rückkehr zum Hafen erklärt ein Mann von der Asienabteilung namens Wong, Allen sei gefunden und in ihrem Hauptquartier (womit er andeutet, dass Allen tot sei), zudem meint er, dass die Exorzisten ihre Reise nach Japan ohne Allen fortsetzen sollen, aber als sein Ersatz, Miranda Lotto mitnehmen, ist es ihr möglich die Schäden am Schiff durch ihrer Anti-Akuma Waffe zu beheben, sodass die Exorzisten ihre Reise fortsetzen können?

Allen öffnet endlich die Augen und fragt sich, wie er noch am Leben sein kann. Bak, der Chef des asiatischen Hauptquartiers, erzählt ihm, dass sein eigener Innocence ihm das Leben rettete, indem es die Form einer Partikelwolke annahm und so das Loch in seinem Herzen füllte. Allen ist fest entschlossen, zu seinen Gefährten in Edo zurückzukehren und sein Versprechen an Mana zu erfüllen, er schwört, seine Innocence um jeden Preis zu reparieren, doch er stellt fest, dass es nicht so einfach ist, wie er erst dachte! Zudem trifft Allen auf Wong, den Assistenten von Bak, zudem auf Fou, die Wächterin des asiatischen Hauptquartiers, und auf drei Mitarbeiter der Abteilung: Rikei, Shifu und Lou Fa.

Entschlossen alles nötige aufzubringen, um sein Innocence wiederherzustellen, beginnt Allen sein training mit Fou, indem Allen im Kampf mit Fou unermüdlich versucht sein Innocence zu aktivieren. In der Zwischenzeit kehren Kommandant Klaud Nine und Kommandant Winters Sokaro zum Orden zurück, nachdem sie erfuhrten das ihre Exorzisten-Einheiten tot sei.

Zurück auf dem Schiff in Richtung Edo, akzeptiert Lenalee letzten Endes Allens Abwesenheit und zieht ihre neue Uniform an. Ungeachtet dessen verbleibt ihr Schiff jedoch im Kampf mit einem Level 3. Akuma namens Eshii, welcher ein ehemaliger Autor war, dementsprechend hat der Akuma die Angewohnheit vor jeder Attacke „Titel“ zu sagen. Lavi, Krory und Bookman kämpfen erbittert gegen Eshii, allerdings ist ihr Gegner zu starke und Bookman unterlag infolgedessen seiner Verletzung, aus diesem Grund, entschloss sich Lenalee das Schiff zu verlassen um die große Bedrohung vom Schiff wegzulocken.

Lenalee und Eshii setzen ihren erbitterten Kampf im Himmel fort, währenddessen ihr Schiff unter Offensive des Gegners litt. Viele Crewmitglieder standen unter ebenfalls unter Beschuss und starben, sie konnten jedoch durch Miranda's Innocence wiederauferstehen. Um zu helfen versucht Lavi herauszufinden, wie er einen unsichtbaren Feind besiegen kann. Mitlerweile erreicht der Kampf zwischen Lenalee und Eshii die Wasseroberfläche, so kann Eshii seine wahre Kraft offenbaren. Er benutzt Dunkle Materie um Ketten rund um Lenalee und das Schiff zu spannen, diese Ketten erhöhen die Schwerkraft, sodass die Schiffsmitlieder Unterwasser gedrückt werden. Somit fällt es Lenalee schwer, sich über dem Wasser zu halten, zusätzlich drückt Eshii sie hinunter, sodass sie in den Wassermaßen versinkt. Lavi und Krory tüftelten ein Plan aus, welcher ihn hilft, die Akumas besser zu töten.

Lenalee, erinnert sich an Allen und an das, was sie ihm über ihre Weltanschauung gesagt hat. Hiernach treibt Lenalee ihr Innocence an ihr Maximum sodass sie ihre Grenzen überschreitet, somit ist es ihr möglich Eshii's Kraft zu übertreffen.

Während Lenalee gegen den Akuma der 3. Stufe kämpft, versuchen die Matrosen und Exorzisten auf dem Schiff, das Schiff vor weiteren Akuma zu schützen. Nachdem sie die Akuma endlich besiegten, warteten sie nun sehnsüchtig auf Lenalees Rückkehr.

Lenalee wurde von ihren Innocence beschützt und mit hilfe von Cross Marian's konverierten Akuma, gelang es Lavi Lenalee zurück zum Schiff zu bringen, jedoch ist es Lenalee nicht mehr fähig zu Laufen. Ein Akuma auf lvl. 2 erklärt, dass es in Japan mehrere Akuma auf lvl. 2 und auch auf noch mit höheren Level gibt. Nachdem sie die Gefahren abwagen setzten sie die Reise nach Japan fort, Miranda deaktivierte ihr Innocence sodass sie nicht mehr die Crew vor ihren sicheren Tot bewaren konnten. Drei Crewmitglieder überlebten und folgten den Exorzisten nach Edo um Cross Marian zu finden, währendessen versucht Allen weiterhin seinen Innocence in die ursprüngliche Form zu rematerialisieren.