In dieser Staffel führt Will den Glee-Club zu neuer Größe, obwohl sein eigenes Leben immer komplizierter wird.
Das neue Schuljahr an der McKinley High School beginnt mit alten Problemen: Direktor Figgins kürzt das Budget von Sues Cheerleadern und Wills Glee Club zu Gunsten der Football Mannschaft.
Während Will seine Schüler gern von "Easy Listening" überzeugen will, zieht es den Glee Club eher zu der Musik von Britney Spears. Aber Will ist davon wenig begeistert.
Finn gerät in eine existentielle Krise, als er glaubt, das Antlitz von Jesus in seinem gegrillten Käse-Toast zu erblicken. Er hält dies für ein Zeichen.
Duettgesang ist das Motto der Woche. Finn und Rachel wollen einem neuen Mitglied zu einem respektablen Einstand im Gesangsclub verhelfen.
Will ist eifersüchtig als er erkennt, dass Emma mit ihrem neuen Freund Carl glücklich ist. Der Glee-Club widmet sich einem schaurig schönen Thema: "The Rocky Horror Glee Show".
Sams Beziehung zu Quinn gerät durch ein Missverständnis in eine Krise - doch was hat Trainerin Beiste damit zu tun? Kurt kann die ständigen Anfeindungen von Karofsky nicht mehr ertragen.
In der Folge "Ersatzspieler" feiert eine der bekanntesten Schauspielerinnen Hollywoods ihren Einstand bei "Glee": Gwyneth Paltrow übernimmt die Rolle der Lehrerin Holly Holliday.
Die McKinsey High hat das Hochzeitsfieber gepackt: Kurts Vater und Finns Mutter möchten heiraten. Doch während Kurt begeistert ist, zeigt Finn dafür wenig Verständnis.
Die Sectionals stehen vor der Tür, doch im Glee-Club läuft momentan alles schief: Finn und Rachels Beziehung gerät in eine Krise. Kurt muss an der Daltons Academy einiges einstecken.
Von besinnlicher Stimmung kann keine Rede sein: Brittany glaubt noch an den Weihnachtsmann, doch ihren sehnlichsten Wunsch kann niemand erfüllen - erst recht nicht Kurt.
Auf der Suche nach neuen Inspirationen für die Auftritte der Cheerios wird Sue schnell fündig: Mit Hilfe einer Zirkuskanone will Sue Brittany über das Footballfeld schießen.
Der Valentinstag steht bevor und so lautet das Motto des Glee Clubs natürlich "Liebeslieder". Doch was für den einen Freud, ist des anderen Leid.
Die Niederlage bei den Cheerleader-Meisterschaften stürzt Sue in eine schwere Krise. Um Quinns Aufmerksamkeit zu gewinnen, verändert Sam sein Aussehen. Rachel versucht alles, um endlich nicht mehr als Außenseiterin zu gelten - wird ihr das gelingen?
Schulleiter Figgins macht Will auf ein eklatantes Problem an der McKinley High aufmerksam: Alkoholmissbrauch. Immer mehr Schüler kommen betrunken in den Unterricht.
Will bekommt wieder einmal Unterstützung von Aushilfslehrerin Holly Holliday und die hat er auch bitter nötig, als im "Glee"-Club das Thema "Aufklärung" zur Sprache kommt.
Die "Regionals" stehen an und der "Glee"-Club, die "Warblers" und der "Aural Intensity" Club stecken mitten in den Vorbereitungen.
Dem "Glee"-Club fehlt das nötige Kleingeld, um zu den "Nationals" nach New York fahren zu können - bedeutet dies nun das endgültige Aus?
Finn bricht Rachel beim Tanztraining die Nase und löst damit eine folgenschwere Diskussion aus: Während einige der Glee-Mitglieder lernen müssen, ihre Schwächen zu akzeptieren, nutzen Santana und Lauren diese wiederum, um daraus Profit zu schlagen.
Brittany startet ihre eigene Internet-Talkshow und begrüßt als erste Gäste Tina und Mercedes. Beide gelten als die Klatsch-und-Tratsch-Experten schlechthin.
Die Wahl zum Königspaar des Abschlussballes geht in die heiße Phase. In einer Umfrage liegen Quinn und Finn auf dem ersten Platz, dicht gefolgt von Puck und Lauren.
Die letzten großen Proben für die "Nationals" stehen an und der ehemalige Sänger von "Vocal Adrenaline", Jessie St. James, greift Will bei den Vorbereitungen unter die Arme.
Endlich ist es soweit: Der Glee-Club macht sich auf den Weg nach New York. Dort angekommen, sind alle überwältigt von der beeindruckenden Metropole, besonders Rachel.