Das NCIS-Team muss Torres helfen, als er seine Zukunft aufs Spiel setzt, indem er sich dem Mann stellt, der als Kind seine Familie gequält hat.
Während der NCIS um Ducky trauert, finden die Agenten Trost in der Arbeit an einem seiner unvollendeten Fälle, in dem es um eine Frau geht, deren Vater unehrenhaft beim US Marine Corps entlassen wurde.
Als das NCIS-Team am Walk-a-Mile-Tag teilnimmt, um neue Perspektiven für verschiedene Abteilungen zu gewinnen, nehmen die Dinge eine Wendung, als Kasie einen Notruf von einem mysteriösen Mann erhält.
Ein Officer der Navy, Derek Bailey, wird entführt und seine Verlobte Tanya wendet sich erst drei Tage nach dessen Verschwinden an das NCIS-Team. Bailey fand erst vor kurzem seinen Vater, den Milliardär Ron Davenport, und die Entführer fordern nun ein Lösegeld von drei Millionen Dollar von Ron. Nachdem Tanya ebenfalls verschwindet, zahlt Davenport die geforderte Summe. Den Ermittlern gelingt es, das Handy des Täters zu orten, woraufhin sie sofort die Festnahme planen.
Mit der Hilfe von Knights Vater arbeitet der NCIS daran, das Geheimnis einer kürzlich benutzten Dienstwaffe zu lüften, die einem vermissten Agenten gehört. Außerdem gerät McGee ins Trudeln, als die DNA-Ergebnisse einen nahen Verwandten offenbaren, den er nicht kannte.
Nachdem die Leiche eines Navy-Piloten mit ungewöhnlichen Wunden gefunden wurde, führt die Untersuchung des NCIS das Team in den Kaninchenbau der UFO-Verschwörungstheorien.
Der NCIS wird von einem mysteriösen Feind aus der Vergangenheit angegriffen. Außerdem versucht Vance, sich mit seinem entfremdeten Sohn zu versöhnen, indem er erklärt, warum er trotz der ständigen Gefahren in seinem Job beim NCIS bleiben will.
Das NCIS-Team sucht nach einem Motiv für die Entführung und den Tod eines berühmten Herzchirurgen.
Die Überreste eines Marine-Captains werden entdeckt. Die Leiche wurde zerstückelt. Das Seltsame dabei: Das Opfer ist bereits seit drei Jahren tot. Die Spur führt Knight und Torres nach Texas. Delilah will unterdessen ihre Küche renovieren und greift dabei auf die Hilfe eines Reality-TV-Stars zurück. Tim ist alles andere als begeistert.
Ein altes Schiff der Navy soll auf den Grund des Meers gesenkt werden und in ein künstliches Riff verwandelt werden. Bei den Arbeiten werden drei Leichen entdeckt. Knight und Parker finden Hinweise auf eine verdächtige Person - und werden von dieser auf dem Schiff eingesperrt. Derweil bahnt sich für ein langjähriges Teammitglied ein Positionswechsel innerhalb des NCIS an.