Kate Moretti bittet Daniel, die geistige Zurechnungsfähigkeit eines Mörders zu überprüfen, dessen Fall erneut verhandelt werden soll. Die Ergebnisse bringen eine unerwartete Wendung: Ist der Untersuchte die gleiche Person wie vor sechs Jahren?
Eine Frau meldet, ihr Mann sei von Aliens entführt worden. In der Zwischenzeit läuft es zwischen Pierce und Caroline immer besser. Aber die Beziehung steht auf dem Spiel, wenn er seine imaginäre Freundin nicht aus dem Kopf bekommt.
Als eine Serie von seltsamen Morden in der Öffentlichkeit geschieht, wird Pierce klar, dass der Mörder versucht, auf Blindheit durch Unaufmerksamkeit hinzuweisen. Donnie bezweifelt diese Theorie.
Pierce nimmt die Einladung einer berühmten Umweltaktivistin an. Er soll einen Fall bearbeiten, bei dem es um mehrere junge Mädchen geht, die an abnormalen neurologischen Reaktionen leiden.
Pierce und Morretti tauchen in die virtuelle Welt ein, um den Mord an einem Mann aufzuklären, der die meiste Zeit in einem Online-Rollenspiel verbrachte.
Ein neues Gerät für das Gehirn, das Muskelzittern verhindern soll, scheint einen Defekt zu haben. Bald stellt sich jedoch heraus, dass es sich um mehr als eine technische Störung handelt. Pierce und Donnie ermitteln gemeinsam.
Moretti nimmt am Sterbebett das Geständnis eines Mannes ab, der 1992 einen Mord mit Fahrerflucht an einem Teenager begangen hat. Sie bittet Pierce darum, die Glaubwürdigkeit des Kranken zu überprüfen.
Pierce untersucht den Fall einer Frau, die auf grausame Weise in einer psychiatrischen Klinik erstochen wurde. Als ihm Sigmund Freud erscheint, ist Pierce davon überzeugt, dass das Krankenhaus voller dunkler Geheimnisse ist.
Donnie versucht, einer Kriegsheldin zu helfen, die an neurologischen Störungen leidet. Was jedoch als gute Tat gedacht war, hat schwerwiegende Folgen. Inzwischen erlebt Pierce eine Überraschung, als seine Jugendliebe auftaucht.
Moretti wird angeklagt, nachdem sie in einem gefährlichen Fall die Dinge selbst in die Hand genommen hat. Pierce und Donnie wollen ihren Ruf wiederherstellen. Aber als es widersprüchliche Beweise gibt, bekommt sogar Kate Zweifel an ihrer Unschuld.
Mit Hilfe seiner Halluzination, dem Baseballer Mordecai "Three Finger" Brown, kämpft Pierce für einen autistischen Teenager, der zu einem Mordfall vernommen wird. Dean Haley versucht, ein Wunderkind zu überzeugen, an die CLMU zu kommen.
Pierce und Lewicki sind ziemlich überrascht, als Lewickis Bruder Kenny unangemeldet auftaucht. Aufgrund einer unglücklichen Wendung der Ereignisse wird Kenny zum Hauptverdächtigen in einem Mordfall. Pierce ist hin- und hergerissen.
Spannungen zwischen der CIA und dem FBI entstehen, als Pierce einen Hinweis bekommt, dass die CIA angeblich U.S. Bürger beseitigen lässt. Die Situation wird komplizierter, als einer von Pierces engen Freunden ermordet wird.
Pierces geistige Stabilität steht infrage und sein Job schwebt in Gefahr, als er anklagt wird, seine Ex-Freundin Caroline Newsome zu stalken. Als die Situation außer Kontrolle gerät, versucht Moretti den wahren Stalker zu finden.