Als Aku wiederaufersteht, um sein Schreckensregime zu errichten, wird der Sohn des Kaisers fortgeschickt, um die Wege der Samurai zu erlernen. Der Junge wird zum Mann und versucht, Aku mit einem mächtigen Schwert zu töten, doch Aku verbannt ihn in die Zukunft.
Der Samurai landet in der Zukunft und erhält den Namen Jack. Er wird von einer Rasse von Hunden angeworben, um Aku zu vernichten.
Jack besorgt sich Waffen und schlägt Akus Käferarmee in die Flucht, wodurch er die Hunde rettet.
Jack hilft dabei, die Woolies von den tyrannischen Chritchelliten zu befreien.
Jack tut sich mit ein paar Gangstern aus Chicago zusammen, um zu versuchen, an Aku heranzukommen.
Aku erzählt den Kindern Märchen, um sie auf seine Seite zu ziehen, statt auf die von Jack.